To molekyler CO2 blir bundet til acetyl-CoA og omdannet til succinyl-CoA , videre til acetaoacetyl-CoA, deretter kløyvet til to molekyler acetyl-CoA, hvorav den ene kan inngå i syklusen på nytt og den andre i blir brukt i oppbygging av bakterien.
Acetyl-CoA blir reduktivt karboksylert til pyruvat
Acetyl-CoA → pyruvat → fosfoenolpyruvat → oksaloacetat → fumarat → succinat → succinyl-CoA → succinat semialdehyd → 4-hydroksybutyrat → krotonyl-CoA → 3-hydroksybutyryl –CoA → acetoacetyl-Co A → 2 molekyler acetyl-CoA.