Det første enzymatiske trinnet katalyseres av en nitrat reduktase som inneholder molybden og produktet er nitritt (NO2-). Neste trinn katalyseres av nitritt reduktase som er forskjellig fra det assimilatoriske enzymet.
Nitrat reduktase:
NO3- + 2e- + 2H+ ↔ NO2- + H2O
Neste trinn er nå enten til ammonium eller til nitrogen.
Det er mange forskjellige typer nitritt reductase som katalyserer overgangen NO2- → NH4+
Veien til nitrogengass (N2) skjer via intermediatene nitrogenmonoksid og lystgass.
Nitritt reduktase som også kan katalysere nitritt til nitrogenmonoksid (NO):
NO2- + 2e- + 2H+ ↔ NO + H2O
Nitrogenoksid reduktase:
2NO + 2e- + 2H+ ↔ N2O + H2O
Dinitrogenoksid reduktase:
N2O + 2e- + 2H+ ↔ N2 + H2O
Oppsummert:
2NO3- + 10e- + 12H+ → N2 + 6H2O
Noen bakterier kan redusere nitritt til ammonium. De fleste denitrifiserende bakteriene er fakultativt aerobe. Elektronkilder for vekst kan være f.eks. acetat, succinat eller etanol.
Bakterier inneholder i tillegg til assimilatorisk nitrat reduktase, dissimilatorisk respiratorisk (nitratrespirasjon) nitrat reduktase i membraner, samt dissimilatorisk nitrat reduktase i periplasma.
Dissimilatorisk nitrrittreduksjon
Dissimilatorisk nitrrittreduksjon er ogs kalt respiratorisk nitritt ammonifisering
Reduksjon av nitritt kan enten skje assimilatorisk for å alge ammonium som skal inngå i organiske molekyler i metabolismen i planter eller bakterier) eller alternativt dissimilatorisk hvor nitritt blir brukt som terminal elektronakseptor hos bakterier under anaerobe forhold hvor det ikke er oksygen tilstede. Redokspotensialet E0’ ved pH= 7 for redoksparet NO2−/NH4+ ved pH=7 E0’= +0.34 V og tilsvarende for redoksparene format/CO2 er E0’= −0.42 V , redoksparet H2/H+ E0’=−0.42 V) og svoelparet HS−/So E0’=−0.27 V (elektrokjemi).
Respiratorisk nitritt ammonifisering hos anaerobe bakterier hvor vor det blir laget en elektrokjemisk protongradient over membraner brukt til frakte elektroner fra format (HCOO-) eller hydrogen (H2) til nitritt
Enzymet cytokrom c nitritt reduktase katalyserer reduksjon av nitritt (NO2-) til ammonium med bruk av seks elektroner o g deltar i reduksjon av nitrat til ammonium. Cytokrom c nitritt reduktase blir brukt i anaerobe bakterier som bruker nitritt som terminal elektronakseptor under anaerobe forhold hvor det ikke er oksygen tilstede. Reaksjonen er viktig i global nitrogensyklus. Elektroner blir fraktet fra respiratoriske kinoner i elektrontransportkjeden og enzymene format dehydrogenase og hydrogenase blir brukt til å lage en protondrivende kraft
Format dehydrogenase kan katalysere reaksjoner som omdanner format (maursyre)
formate + NAD+ ↔ CO2 + NADH + H+
format + 2 ferri(Fe3+)cytokrom b1 ↔ CO2 + 2 ferro(Fe2+)cytockrom b1 + 2 H+
Eller via en hydogenase
Totalreaksjon for format:
HCOO- + NO2- + 5H+ → 3CO2 + NH4+ + H2O
Totalreaksjon med hydrogen (H2):
3H2 + NO2- + 2H+ → NH4+ + H2O
Eller med hydrogensulfid (HS-) hvor det blir dannet svovelkorn (So):
3HS- + NO2- + 5H+ → + NH4+ + 3So + 2H2O
Eksempler på bakterier som vokser anaerobt med espiratorisk nitritt ammonifisering er Desulfovibrio desulfuricans (H2), Escherichia coli (format), Desulfovibrio gigas (H2), Campylobacter sputorum (format), Wolinella succinogenes (format), og har en viktig funksjon i global nitrogensyklus.
Litteratur
Wikipedia