Immunoglobuliner binder seg bare til et spesifikt område av et antigen kalt epitope.En epitope er en del av et antigen som blir gjenkjent av immunsystemet og kan bestå av fem til åtte aminosyrer som utgjør en liten del av et større protein, eller det samme antall monosakkarider ordnet i en spesifikk tredimensjonal struktur (epitopekonformasjon) som har et korresponderende komplementært bindingssete på en del av at antistoff eller angigenbindende reseptor på B-celler eller T-celler.
Neoepitoper virker som et tumorspesfikt antigen og er en del av major histokompatibilitetskomplekset (MHC) som skyldes mutasjoner og kan bli anvendes som mål for immunoterapi mot kreft.