Soppslekter som inngår i mykobiomet og gir biodiversitet er for eksempel Candida, Malassezia, Saccharomyces, Cladosporium, Alternaria, Aspergillus, Histoplasma, Mucor, Fusarium, Penicillium , Trichosporum. De fleste er ascomyceter (Ascomycota), men kan også være basidiomyceter (Basidiomycota), koblingssopp (Zygomycota) eller endomykorrhizasopp (Glomeromycota). Noen av sopp er relatert til sykdomstilstander, mens andre er kommensaler. På planterøtter inngår mykobiomet i mykorrhiza.
Humant mykobiom
Mykobiomet i magetarmsystemet består av gjærsopp blant annet slektene Candida og Saccharomyces som lever i tilknytning til mikrobiomet er med bakterier, og sopp utgjør ca. 0.1% av det humane mikrobiomet. Økt vekst av mykobiomet på bekostning av mikrobiomet kan gi dysbiose.
Sopp som finnes i mykobiomet tilhører blant annet orden Saccharomycetales og orden Mallasseziales.
Trøskegjær (Candida albicans) er en naturlig del av mykobiomet som inngår i mikrobiomet som med ved forstyrrelser som utkonkurrerer bakterier blant annet ved bruk av antibiotika eller immunsenkende midler kan den forårsake candidiasis gi munnhule (trøske på tunga), tarm eller skjede /vagina (candidavaginitt) eller på hud og negler. Candida tropicalis , Candida parapsilosis , Candida glabrata og
og Candida dubliniensis er andre arter Candida som kan inngå i et mykobiom, samt Debaryomyces hansenii syn. Candida famata.
Malassezia inngår som en del av mikrobiomet på huden.
Taksonomi
Slekten Candida er taksonomisk plassert i rekke sekksporesopp, ascomyceter (Ascomycota) underrekke Saccharomycotina, klasse Saccharomycetes med en orden Saccharomycetales, familie Saccharomycetaceae.
Slekten Malassezia er taknonomisk plassert i rekke stilksporesopp basidiomyceter Basidiomycota klassen Malasseziomycetes, underrekke Ustilaginomycotina, orden Malasseziales , familien Malasseziaceae.
Aspergillus clavatus gir aspergillosis, taksonomisk plassert i rekke Ascomycota, klasse Eurotiomycetes, orden Eurotiales, familie Aspergillaceae.
Cryptococcus deformans kan gi cryptococcosis taksonomisk plassert rekke Basidiomycota, klasse Tremellomycetes, orden Tremellales, familie Cryptococcaceae.
Litteratur
Wikipeda