Respirasjonen har ikke bare en viktig funksjon med å skaffe cellen reduksjonskraft og ATP. Respirasjonen lager også viktige intermediater som er utgangspunkt for andre metabolismeveier:
1) Ketosyrer kan omdannes til aminosyrer ved transaminering.
2) Acetyl-CoA er et viktig utgangspunkt for syntese av fettsyrer og forbindelser laget av isopren.
3) Erythrose-4-fosfat fra oksidativ pentosefosfatvei danner utgangspunkt for syntese av aromatiske aminosyrer og videre syntese i sekundærmetabolismen av flavonoider og lignin.
4) Ribose-5-fosfat fra oksidativ pentosefosfatvei er utgangspunkt for ribose og deoksyribose som inngår i henholdsvis RNA og DNA.