A Ala Alanin
C Cys Cystein
D Asp Aspartat, asparaginsyre
E Glu Glutamat, glutaminsyre
F Phe Fenylalanin
G Gly Glycin
H His Histidin
I Ile Isoleucin
K Lys Lysin
L Leu Leucin
M Met Methionin, metionin
N Asn Asparagin
P Pro Prolin
Q Gln Glutamin
R Arg Arginin
S Ser Serin
T Thr Threonin, treonin
V Val Valin
W Trp Tryptofan
Y Tyr Tyrosin
I tillegg brukes:
B Asx for enten asparagin eller aspartat hvor analysemetoden ikke skiller disse
Z Glx for enten glutamin eller glutamat hvor analysemetoden ikke skiller disse
X Ukjent, eller ikke standard aminosyre
Den amerikanske biokjemikeren Margareth Oakley Dayhoff (1925-1983) er kreditert å utvikle trebokstavkoden for aminosyrer og hun betraktes også som en av grunnleggerne av fagområdet bioinformatikk.
