Homeose viste seg Morgans lab i genetiske studier av bananflue (Drosophila melanogaster) hvor kroppsledd endret utseende, e.g. mutasjon i en klynge homeotiske gener Antennapedia – komplekset gir bein på hodet i stedet for følehorn. Mutasjon i Ultrabithorax –komplekset gjør at svingkøller omdannes til et ekstra par med vinger på tredje kroppsledd. Et annet eksempler er polydaktyli (gr. poly – mange; daktylos – finger) hos mennesker som har fått en ekstra finger på hånden, vanligst ekstra lillefinger. Edward B Lewis, Christiane Nüsslein-Volhard og Eric F Wieschaus fikk nobelprisen i fysiologi eller medisin i 1995 for «oppdagelser av genetisk kontroll av tidlig embryoutvikling».
Hos dyr kan det oppstå homeose ved mutasjoner i Hox-gener som lager proteiner med DNA-homeoboksdomener som bindes til DNA, og hos planter i MADS-boksgener som lager proteiner med DNA-bindende MADS-boks domener. Dyr også kan lage noen MADS-faktorer. Hos dyr er det homeotiske gener som bestemmer kroppsaksen hva som blir foran (anterior) og bak (posterior), og aksen eller kroppsplanet ryggside (dorsalt) og bukside (ventralt) med de tilhørende organer tilknyttet disse kroppsaksene. Homeotiske gener koder for proteiner som virker som transkripsjonsfaktorer eller har funksjoner som effektorer i signalveier som styrer utviklingsprosesser av kropp og organer. Eksempler på slike signalveier er Notch signalveien og BMP-signalveien. Hos dyr finnes det også noen homeoboksproteiner som ikke blir kodet av homeotiske gener.