Norwalkvirus er et norovirus, som hadde utbrudd i Norwalk, Ohio i 1968. Diaré-sykdommer er alvorlige i overbefolkede områder med dårlige sanitærforhold, lite utbygd helsevesen, kombinert med lite mat, urent drikkevann og andre sykdommer.
Norovirus og molekylærbiologi
Norovirus er pluss sens (+sens) enkelttrådet RNA-virus. Ustabiliteten i RNA rask utvikling og evolusjon av nye virusvarianter av norovius endrer stadig sitt genmateriale og gir sporadisk. Norovirus har epokal evolusjon likt det man finnes influensavirus A /H3N2. Positiv sens betyr at RNA-tråden etter binding til ribosomer virker som et mRNA og kan inngår dirkete i biosyntese av virusproteiner med bruk av vertscellens apparat for proteinsyntese. Nysyntetisert virusprotein gjennomgår posttranslasjonsmodivisering med oppdeling av polyprotein i mindre deler katalysert av virus protease. Det er vanskelig å dyrke humant norovirus i cellekulturer.
Diaré-sykdommer er alvorlige i områder med dårlige sanitærforhold, kombinert med lite mat, urent drikkevann og andre sykdommer,
Norovirus og molekylærbiologi
Norovirus er pluss sens (+sens) enkelttrådet RNA-virus. Ustabiliteten i RNA rask utvikling og evolusjon av nye virusvarianter av norovius endrer stadig sitt genmateriale og gir sporadisk. Norovirus har epokal evolusjon likt det man finnes influensavirus A /H3N2. Positiv sens betyr at RNA-tråden etter binding til ribosomer virker som et mRNA og kan inngår dirkete i biosyntese av virusproteiner med bruk av vertscellens apparat for proteinsyntese. Nysyntetisert virusprotein gjennomgår posttranslasjonsmodivisering med oppdeling av polyprotein i mindre deler katalysert av virus protease. Det er vanskelig å dyrke humant norovirus i cellekulturer.
Norovirusgenomet ssRNA+ har størrelse 7.5 kilobaser (kb), hvor RNA koder for et sort polyprotein og er delt inn i tre åpne leserammer ORF1-3 (gjelder også Vesivirus).
Åpen leseramme ORF1 koder for ikke-strukturproteiner: N-terminal p48-protein, NTPase, 3A-lignende p22-protein, genomkoblet VPg-protein, 3C-lignende protease, og RNA-avhengig RNA polymerase. Ikke-strukturprotein VPg er et genomkoblet protein kovalent bundet til 5’-enden av RNA genomet ssRNA+. VPg blir kløyvd av via virus protease, Virus protease har en viktig rolle i oppdeling av polyprotein til mindre proteiner som deltar i replikering av genomet og patogenese. Viruset kommer inn i cellene via til nå ukjent reseptor. Effekten av virus påvirket av histo-blodgruppeantigener. Gallesyrer kan delta i utpakking av viruset. Frigivelse av RNA VPg interagerer med translasjonskonplekset i vertscellens elongeringsfaktor elF3.
Åpen leseramme ORF2 koder for lhovedstrukturprotien VP1 med 90 dimere VP.protein til kapsid.
Åpen leseORF3 koder for det mindre struktuproteine VP2 som befinner seg på på innsiden av kapsidet, fra 1-8 proteiner per virion.
Norovirus har epokall evolusjon likt det man finnes influensavirus A /H3N2.
Genomstørrelse 8.3 kbp tre åpne lesereammer hos (ORF1, ORF2 og ORF3)
Norovirus og Vesivirus som koder for henholds koder for et stort polyproteinm et og og et mindre strukturprotein VP1
To åpne lesetammer ORF1 koder for polyprotein og VP1 og ORV2 koder for VP2 hos Sapovirus, Lagovirus, og Nebovirus koder for
p41 (NTPase), p48, VPg, p22, protease og RNA-avhengig RNA polymerase.
Norovirus og taksonomi
Enkelttrådet positiv-sens RNA virus calicivirus (l. caliculus - koppformet)
i familien Caliciviridae og omfatter slektene: Nebovirus, Norovirus, Sapovirus, Lagovirus og Vesivirus. Viusfamilien Caliciviridae er taksonomisk plassert i orden Picornavirales, klasse Pisoniviricetes og rekke Pisuviricota. Hos Sapovirus, Lagovirus, og Nebovirus har genomet to åpne lesetammer ORF1 koder for polyprotein og VP1 og ORV2 koder for VP2. Calicirus er formet som et ikosaeder og som infekterer virveldyr. Norwalkvirus gir viral gastroenteritt og andre calicirus er hepatitt E-virus og Felin calicivirus hos katter.
Hepatitis E virus i familien familien Caliciviridae er et positiv-sens enkelttrådet RNA-virus uten virusmembran og er formet som et ikosaeder.
Litteratur
Venkataram Prasad BV, Shanker S, Muhaxhiri Z, Choi JM, Atmar RL, Estes MK: Structural Biology of Noroviruses. Viral Gastroenteritis. (2016)329–54. doi: 10.1016/B978-0-12-802241-2.00016-X.
Wikipedia