Det foregår meget aktiv vesikkeltransport i eukaryote celler hvor blant annet endoplasmatisk retikulum, Golgiapparatet, endosomer, cytoskjelett, Rab-proteiner og SNARE-proteiner har viktige funksjoner. ER til Golgi-transportveien av vesikler går til peroksisomer, autofagosomer, omegasomer, og fettdråper. Ekstracellulære vesikler (eksosomer, ektosomer og apoptotitske vesikler) har en viktig funksjon i kroppen og deltar i langsdistansetransport av mRNA, mikro-RNA, proteiner og andre signalstoffer. Feil i vesikkeltransport er medvirkende i flere typer sykdommer hos mennesker.
Sekretoriske vesikler og andre spesialvesikler hos dyr
Sekretoriske vesikler med nevrotransmittoren acetylkolin slippes ut fra nerveenden ut en den synaptiske kløften mellom nerveceller og innholdet tømmes ut.
GLUT4 lagringsvesikler i muskelceller og fettceller inneholder en glukosetransportør 4 (GLUT4), glykoproteinet sortilin, insulinregulert aminopeptidase (IRAP) og LDL reseptorrelatert protein 1 (LRP1). Disse glukosetransportprotein lagringsvesikler med diameter 50-70 nanometer (nm) er forskjellige fra endosomene og blir aktivert av insulin. Vesikler med glukosetransportør 4 fusjonerer med plasmamebranen i muskelceller og fettceller og frakter glukose ut fra blodet og lager glykogen eller fett.
I betacellene i bukspyttkjertel (pankreas) er peptidhormonet insulin pakket i vesikler som blir skilt ut i blodet ved eksocytose i samvirke med SNARE-proteiner (synaptobrevin, syntaksin, synaptosomassosiert protein 25 (SNAP25), vesikkelassosisert membranprotein (VAMP), samt Rab-proteinet Rab3A.